O Apostolado Mundial de Fátima, sendo uma organização internacional, está presente nos cinco continentes. Cada continente tem um ou mais centros regionais, os quais servem como ponto de referência para o grupo de países que a ele pertencem. O centro regional tem também a tarefa de coordenar e planificar acções pastorais no âmbito da sua região.

A organização nacional do Apostolado Mundial de Fátima divide-se nas seguintes categorias:

• Nação Principal: São aqueles países cuja Conferência Episcopal ou vários Bispos diocesanos do mesmo país tenham reconhecido o Apostolado Mundial de Fátima, por meio de um documento escrito, têm o estatuto de Centro Nacional.
  Além disso, estes países deverão ter realizado eleições de funcionários a nível nacional, nos últimos anos e deverão cumprir o que está estabelecido nos Estatutos Internacionais do Apostolado Mundial de Fátima.
  
• Nações em Formação: São aqueles países onde um ou mais Bispos reconheceram o Apostolado de Fátima, mas ainda não realizaram eleições a nível nacional.
  
• Nações Principiantes: São aqueles países onde existem membros individuais, mas que não obtiveram ainda o reconhecimento de nenhum Bispo diocesano nem realizaram eleições a nível nacional.